提速近10倍!基于深度学习的全基因组选择新方法来了******
近日,中国农业科学院作物科学研究所、三亚南繁研究院大数据智能设计育种创新团队联合多家单位提出利用植物海量多组学数据进行全基因组预测的深度学习方法, 可以实现育种大数据的高效整合与利用,将助力深度学习在全基因组选择中的应用,为智能设计育种及平台构建提供有效工具。相关研究成果发表在《分子植物(Molecular Plant)》上。
全基因组选择作为新一代育种技术,通过构建预测模型,根据基因组估计育种值进行早期个体的预测和选择,从而缩短育种世代间隔,加快育种进程,节约成本,推动现代育种向精准化和高效化方向发展。
统计模型作为全基因组选择的核心,极大地影响了全基因组预测的准确度和效率。传统预测方法基于线性回归模型,难以捕捉基因型和表型间的复杂关系。
相较于传统模型,非线性模型(如深度网络神经)具备分析复杂非加性效应的能力,人工智能和深度学习算法为解决大数据分析和高性能并行运算等难题提供了新的契机,深度学习算法的优化将会提高全基因组选择的预测能力。
该研究团队以玉米、小麦和番茄3种作物的4种不同维度的群体数据为测试材料,通过创新深度学习算法框架开发了全基因组选择新方法。
与其他五种主流预测方法相比,该方法有以下优点: 可以利用多组学数据开展全基因组预测;算法设计中包含批归一化层、回调函数和校正线性激活函数等结构,可以有效降低模型错误率,提高运行速度;预测精度稳健,在小型数据集上的表现与目前主流预测模型相当,在大规模数据集上预测优势更加明显;计算时间与传统方法相近,比已有深度学习方法提速近10倍;超参数调整对用户更加友好。
该研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金、海南崖州湾种子实验室和中国农业科学院科技创新工程等项目的支持。
学术支持
中国农业科学院作物科学研究所
记者
宋雅娟
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(文图:赵筱尘 巫邓炎) [责编:天天中] 阅读剩余全文() 推荐阅读 168彩票官网平台孙继海:在中国踢球心很累 足球没站起来却先富起来 2024-08-14 168彩票计划群 现在入手甜品卡 GTX 1660和RX 590选哪个? 2024-04-26 168彩票必赚方案美阿帕奇直升机服役33年仍居榜首 中国武直差在哪 2024-04-24 168彩票漏洞丰田搁置2021年为新车搭载DSRC技术计划 2024-05-17 168彩票玩法年轻“粮食人”叶金的大梦想 2024-08-11 168彩票注册网新奔驰刚开1小时差点要了命 4S店:退车不太可能 2024-08-21 168彩票APP让红色文化资源利用与城市更新有机融合 2024-05-25 168彩票充值 乐清“失联”男孩母亲被判1年3个月 量刑过重? 2024-07-27 168彩票网投 31岁男子用假驾照被罚 父母质问交警:他还是个孩子啊 2023-12-24 168彩票技巧刘强东退出章泽天"处女投"公司 2024-07-10 168彩票开奖结果嫡女嚣张:鬼王独宠俏医妃 2023-10-01 168彩票注册 美大使挟双航母之威喊话俄罗斯 莫斯科震怒:我能让它变废铁 2024-04-17 168彩票走势图美国西雅图起重机意外坠落 华裔女大学生被砸身亡 2023-12-26 168彩票网址30岁男子乘公交刷学生卡 被识破拳打司机 2024-01-11 168彩票手机版APP“点亮蓝灯”暨水立方公益基金成立仪式盛大开幕 2023-12-20 168彩票下载带娃哈佛毕业厉害在哪 2024-01-13 168彩票骗局 伊朗无人机为何能贴脸拍美国航母 2023-11-10 168彩票返点国税总局:推行网上预核 实现纳税人线上提交资料 2024-04-05 168彩票下载app中国拒收后美将大量垃圾运这国 被送一句话 2024-08-20 168彩票官网网址亚马逊AI考核:你是不是世界首富的兄弟 2024-02-12 168彩票客户端下载汤神季后赛三分升历史前五 2024-07-18 168彩票代理假期期权双卖收时间价值策略好不好? 2023-11-20 168彩票官方银行卡明明在自己身上 一夜之间却被境外盗刷20万元 2024-02-07 168彩票规则1600米外1枪毙3人的巴雷特步枪竟是发烧友的杰作 2024-06-11 加载更多 168彩票地图 |